La industria salmonera fue largamente cuestionada durante la crisis del virus ISA, la cual los llevó a perder importantes sumas de dinero. Recién en 2011 lograron mejorar su máximo de exportaciones que habían sido 10.000 toneladas en 2007 previo al virus. Este 2012 la industria espera producir 30.000 toneladas principalmente de las empresas Nova Austral y Salmones Magallanes junto a otros productores.
A fines de 2011 habían 890 nuevas concesiones en trámite, y autorizadas 67, las cuales son otorgadas y tramitadas por Sernapesca, luego de un largo proceso el que incluye una evaluación de impacto ambiental.
Según el seremi de Economía Marco Mella, la industria salmonera apotará un “incremento del 5% sobre el PIB regional”, el cual alcanza los US $ 800 millones.

Para el 2015 esperan tener 200 concesiones instaladas, las que producirán 100.000 toneladas generando un impacto en el encadenamiento productivo de la región, como explicó Mella.