El Gobierno Regional (GORE), en conjunto con los organismos involucrados en la confección del Plan Regional de Ordenamiento Territorial (PROT), clasificaron en cuatro las amenazas naturales. En Magallanes surge como principal la volcánica, puesto que existe evidencia que seis presentarían actividad en la zona más austral de Chile.
En la región los identificados son: Lautaro, Viedma, Aguilera, Reclus, Burney y Fueguino.