De acuerdo con el último Censo de Población y Vivienda año 2002, Puerto Natales, registra una población de 19.116 habitantes, de los cuales 16.978 corresponden al sector urbano  y 2.877 al sector rural.  
Al desagregar por sexo, se puede observar que en la comuna viven 10.068 hombres y 9.048 mujeres, siendo el índice de masculinidad de 111,27.
Según las proyecciones demográficas, se estima para  2010 un total de 21.026 habitantes, de los cuales 11.385 corresponderían a población masculina y 9.641 a femenina.