Puerto Edén fue fundado en 1937 por la Fuerza Aérea de Chile como estación de apoyo a una línea aérea experimental de hidroaviones que uniría las ciudades de Pto Montt y Pta Arenas. Alrededor de esta estación se reunió espontáneamente la dispersa población kawesqar, conformadas por nómadas marinos que recorrían las islas entre el golfo de penas y el Estrecho de Magallanes, eran cazadores recolectores que se alimentaban principalmente de mariscos y aves marinas.
 

Posteriormente, con fecha 17 febrero de 1969, fue refundado oficialmente para integrarlo al sistema nacional poblacional.
 
 
La localidad de Puerto Edén, se encuentra ubicada a unos 400 km, al norte de Puerto Natales y pertenece a la jurisdicción municipal de ésta última ciudad ubicada en el sector noreste de la isla Wellington, el poblado trabaja casi en un 90 % en la extracción de cholgas, las cuales una vez que son capturadas, son ahumadas y después vendidas.
 
 
Puerto Edén hoy día cuenta con una escuela básica, un jardín familiar, posta de salud, registro civil, retén de carabineros, capitanía de puerto, biblioteca pública, guardería de la corporación nacional forestal, como también cobertura de agua potable y luz eléctrica, teléfono público satelital, estación repetidora de televisión y radio fm.
 
 
El nombre originario del poblado en kawesqar es jetarktétqal que significa puerto edén debido a su enorme belleza natural.