
Esta comisión creada el año 2006, lleva a cabo reuniones bilaterales anuales, además de reuniones extraordinarias durante el año, alternando sedes en Chile y Argentina, y cuenta como secretario general desde su origen, al Director Ejecutivo de la Fiscalía Regional de Magallanes, Alfredo Fonseca Mihovilovic. Entre los objetivos de esta comisión está el lograr una cooperación directa en materia de asistencia a víctimas y testigos entre las regiones y provincias involucradas, y la definición formal de representantes que faciliten la realización de actividades de interacción en materia de capacitación, pasantías, formación académica y apoyo jurídico penal, así como la asistencia en materia de denuncias de personas presuntamente desaparecidas.
La próxima reunión del Comité de Integración Austral se efectuará en Ushuaia el año 2014, sin embargo la comisión de Cooperación Jurídica en Materia Penal espera materializar este segundo semestre actividades de transferencia de experiencia tanto de fiscales del ministerio público de ambos países, así como generar una agenda de encuentros académicos en materia penal.